Los sistemas agroecológicos son sumamente diversos. Desde el punto de vista biológico, optimizan la diversidad de las especies y los recursos genéticos en distintas maneras.

 

Así lo explica la FAO, al señalarlo como uno de los 10 elementos de la agroecología (Lea: Los 10 elementos de la agroecología)

 

Por ejemplo, los sistemas agroforestales organizan cultivos, arbustos, ganado y árboles de diferentes alturas y formas en distintos niveles o estratos, lo que incrementa la diversidad vertical.

 

El cultivo intercalado combina especies complementarias con el objetivo de aumentar la diversidad espacial. Dicha rotación, en la que a menudo se incluyen legumbres, aumenta la diversidad temporal.

 

Los sistemas integrados de producción agropecuaria dependen de la diversidad de razas locales adaptadas a entornos específicos. (Lea: Ganadería Agro Ecológica: Máxima producción al menor costo posible)

 

En el mundo acuático, el policultivo tradicional de peces, la acuicultura integrada multitrófica o los sistemas agroacuícolas de rotación siguen los mismos principios para aumentar al máximo la diversidad.